MS-DOS memiliki kemiripan dengan Linux, yaitu file system yang bersifat hierarchy. Tetapi, MS-DOS hanya dapat di jalankan pada prosesor x86 dan tidak mendukung multi user dan multi-tasking, serta tidak bersifat free. Juga MS-DOS tidak memiliki dukungan yang baik agar dapat berinteoperasi dengan system operasi lainnya, termasuk tidak tersedianya software network, program pengembang, dan utility yang ada dalam Linux. MS Windows menwarkan kemampuan grafis yang ada pada Linux termasuk kemampuan networking tetapi tetap memiliki kekurangan yang ada pada MS-DOS.